(1)一般活性污泥。一般活性污泥作为一种目前在中国持续发展的比较完善的制药业废水预处理技术，其预备处理的一个过程获得高度重视，爆气的办法获得健全，大大提高了设备运作的稳定。但此方法要进行大量稀释液工作，而且很容易出现污泥负荷等诸多问题，清除效果也是不是太好，因而，需做进一步解决。
(2)SBR法。SBR法一般运用在间断性排出的制药废水且水体水流量起伏比较大的解决工作上，其不仅能够比较好的均化水体，另外还具备淤泥活力高、运作平稳、使用方便、不用污泥回流及其抗冲击性能强等特点。但是其也是有淤泥地基沉降、泥水分离时间比较长等问题。现阶段，SBR法已经运用到青霉素、四环素及其磺胺混和污水等制药废水处理工作上，而且获得了很好的效果。
(3)上流式的厌氧污泥床法(UASB法)。该方法具备结构紧凑、水力停留时间短、厌氧消化工作效率高、不需要另设污泥回流设备等特点。可是缺陷也非常明显，UASB在运行中，对管理方法的要求很高，且运行训化艰难。